Mac OS X 10.5.8でフォントがおかしいです。

Macを再起動して，数式の書かれたPDFファイルをプレビューで開くと，数式のフォントが文字化けします。アクティビティモニタでフォントの管理をしているATSserverを終了してから，同じPDFファイルを開くと文字化けが直ります。ちなみにこのPDFファイルをAdobe Readerで開くと文字化けはしません。

再起動するたびにATSserverの再起動をしないといけないので，困っています。ネットでATSserver関連の文字化けを調べるとフォントキャッシュを削除して作り直せばいいとあったのでためしてみました。

以下のコマンドをターミナルで実行。
$ sudo atsutil databases -remove
$ atsutil server -shutdown
$ atsutil server -ping

確かに文字化けは直りますが，Macを再起動するとやはり文字化けします。

解決方法が分かるという方は教えてください。

[追記]
rootでログインし直してみたら，文字化けはおきませんでした。てことは，自分のホームの中にある設定ファイルのどれかがおかしいのか。